干货分享 | 荧光原位杂交技术

荧光原位杂交技术（FISH）是一种利用荧光信号检测探针的原位杂交技术[1]。它将荧光信号的高灵敏度、安全性及直观性和原位杂交的高特异性结合起来，通过荧光标记的核酸探针与待测样本核酸进行原位杂交。在荧光显微镜下对荧光信号进行辨别和计数，从而对染色体或基因异常的细胞和组织样本进行检测和诊断，为各种基因相关疾病的分型、预前和预后提供准确的依据。FISH染色结果如图1.1所示。

图1.1 FISH染色结果[2]

FISH分为直接法和间接法。

直接法是在已知碱基序列的核酸探针上标记荧光素，在组织切片、间期细胞及染色体标本上与靶核酸进行原位杂交。因所形成的杂交体带有荧光素。故可在荧光显微镜下直接观察。

间接法使用非荧光物质标记的核酸探针。如生物素或地高辛等标记探针，再通过亲和连接或免疫反应带入荧光物质来检测杂交体的存在。

广义上讲，FISH靶序列可以是DNA或RNA，既可以用来进行基因组层面的研究，也可以进行表达层面的研究[1]。

目前常用的荧光素有异硫氰酸荧光素、得克萨斯红、罗丹明及其衍生物四甲基异硫氰酸罗丹明等[3]。

肿瘤已经成为现代人类死亡的主要原因之一，肿瘤的提前确诊对治疗有着极大的帮助。过去诊断细胞样本中是否含有肿瘤细胞主要用巴氏染色法等一些细胞化学染色法。新涌现的辅助诊断技术相比过去的方法更快捷简单，荧光原位杂交技术就是其中之一[4]。

（1）血液肿瘤学

临床上对血液肿瘤的FISH检测主要集中在：染色体异位形成的融合基因的检测；基因缺失检测可以发现一些关键基因的缺失，有助于疾病的诊断及预后判断；使用荧光原位杂交技术可对微小残留病灶进行检测，以及进行造血干细胞移植状态的监测。

（2）实体肿瘤学

目前应用于临床的检测基因突变方法以NGS和PCR为主。与FISH相比，NGS对实验室要求高，同时存在检测周期长和检测费用高等问题；荧光PCR只能够通过标准曲线和标准品进行相对定量，无法做到绝对定量，数字PCR的检测系统成本高，通量有限，操作繁琐，也不能在细胞水平上观察到基因突变的状态，不具备定位的功能。FISH技术可以在间期细胞核上找到DNA扩增的直接证据，而且间期细胞核所显示出的扩增DNA荧光信号的数量多少及荧光强度常与DNA扩增的水平有关。

FISH被广泛应用于乳腺癌、膀胱癌，宫颈癌，肺癌和淋巴癌等实体肿瘤的辅助诊断。目前，FISH主要集中用于对肿瘤的早期诊断、疗效检测，个体化治疗和预后判断等方面[9]。

基因定位是荧光原位杂交的最基础最成功的应用。利用荧光原位杂交灵敏、准确，并且可以一次检测多段基因等特点，可以确定目标基因的准确位置，确定几个基因之间的位置关系，以及基因与染色体端粒之间的关系，基因与着丝点的关系，是构建基因图谱的基本要素。目前荧光原位杂交技术被广泛地应用于基因的物理定位及基因图谱的绘制[4]。

产前诊断是优生优育的重要保障。染色体异常是评价重大出生缺陷性疾病的重要指标。最常见的染色体异常是染色体数目异常，可能引发死胎、流产，即使存活也会使患病儿童畸形、生长缓慢、智力低下等。利用荧光原位杂交技术可以检测染色体非整倍体的特点，采集孕妇羊水，对未培养的羊水间期细胞进行检测，确定其是否为非整倍体，对胎儿染色体异常疾病进行诊断，使产前诊断时间缩短至24～48 h。荧光原位杂交的实验技术和探针的不断改进，应用荧光原位杂交方法进行产前诊断对一些重大染色体异常引起的疾病确诊率已经达到99%，相较于传统诊断方法更快捷，能够减少孕妇等待的痛苦[4]。